由于益生菌種類繁多，不同菌種的特性和習慣不同，大多數情況下我們建議在飯前三十分鐘或者在吃飯時食用，因為這樣的情況下能夠提高益生菌在腸道內的存活率。
研究發現益生菌能夠產生增強免疫力的物質，此物質是維持免疫系統正常運轉的的關鍵物質，長期食用益生菌能夠幫助穩定免疫功能。
我們知道胃腸道疾病發生的原因大多數是因為其中的菌種發生變化，那么益生菌的存在就能很好的抑制這樣的變化發生，從而維持消耗系統的安全穩態。
益生菌在腸道內生產酸性物質，這能幫助腸道保持較合適的消化環境，面對進入的食物能夠很好的完成消化吸收的功能，促進腸道蠕動，保證正常代謝。
益生菌在腸道中工作，會促進蠕動，幫助消化，因此產生的氣體也會有所增加，那么放屁就會增多。
這里推薦雙歧桿菌、乳酸菌、乳桿菌，這是較為優秀的菌種，不推薦腸球菌，這種菌極易被消化，作用時間有限。
益生菌由于自身是非常酸的味道，生產廠家常常會加入不少添加劑來沖淡酸味，這些添加劑對人體都是沒有益處的，那么建議選擇酸奶這種方式來食用益生菌，更天然健康。
我們的目的是益生菌能在腸道中發揮作用，當然不希望在前往腸道的路上就倒下了，那么建議選擇較為領先的包覆技術的益生菌產品，這樣能保護益生菌在前往腸道的路上不被殺死，這樣才能發揮其效能。
